Министарством руководи министар који у складу са законом представља министарство и управља његовим радом.
Министру у руковођењу организацијским јединицама помажу руководећидржавни службеници.
У Министарству се утврђују (4) руководећа радна мјеста и то:
– Секретар Министарства
– Помоћник министра за правосуђе,
– Помоћник министра за управу и локалну самоуправу,
– Главни кантонални управни инспектор,
– Министар може основати стручни колегиј као своје стручно и савјетодавно тијело.
Стручни колегиј чине министар, секретар министарства, помоћници министра и Главни кантонални управни инспектор.